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Etudes cliniques sur la COVID longue

OBJECTIF DE L'ÉTUDE
Le service clinique nouvellement établi à Uppsala poursuivra le travail de l’étude collaborative multicentrique financée par l’OMF sur l’évolution de la COVID en EM/SFC.
CHERCHEURS PRINCIPAUX
  • Jonas Bergquist, MD, PhD
  • Wenzhong Xiao, PhD
MISES Á JOUR ET PERSPECTIVES
  • Les analyses métabolomiques sanguines ont permis d’identifier des métabolites significativement associés aux résultats des patients, notamment la survie, le nombre de jours sans soins intensifs et les défaillances organiques.
  • Un article est en cours de préparation.
HYPOTHÈSE ET DESCRIPTION DE L'ÉTUDE
Le service clinique offre la possibilité de continuer à étudier le processus de la maladie au fur et à mesure de son évolution et, espérons-le, de mieux comprendre l’EM/SFC.  Un sous-ensemble de patients précédemment gravement malades sera suivi pour la progression de la maladie au fil du temps, aux côtés de patients atteints de COVID longue mais à un stade non critique, qui se rendront également dans le service pour des symptômes persistants.   Comme pour l’étude précédente, les chercheurs utiliseront la génomique, la protéomique, la métabolomique et l’immunologie pour récupérer autant de cellules immunitaires que possible et caractériser leur évolution vers l’EM/SFC. De plus, nous étudions le plasma et le liquide céphalo-rachidien (LCR) pour identifier les protéines et les grosses molécules (p. ex., les anticorps) ainsi que les petites molécules qui apparaissent ou disparaissent en association avec le développement de l’EM/SFC.
OBJECTIFS

Une illustration 3D du COVID-19

Étude A :

Recruter environ 50 patients présentant une infection COVID légère confirmée (confirmée par une analyse d’anticorps ou un test PCR positif) et des symptômes à long terme plus de 12 semaines après l’infection, recrutés via le service clinique Postcovid. Inviter 50 témoins appariés en âge et en sexe qui ont subi une infection confirmée par la COVID mais qui ne présentent pas de symptômes à long terme ou de séquelles de l’infection.

Les patients et les témoins devront effectuer divers tests psychométriques et remplir des questionnaires : Échelle de gravité de la fatigue FSS, MADRS, test MOCA, test assis-debout de 1 minute, test orthostatique, RAND-36, BANS, EQ-5D- SL et échelle MPE de DePaul.

Les patients et les témoins doivent fournir un total de 30 ml de tube de plasma EDTA. Les cellules sanguines isolées (PBMC) ainsi que l’ADN et l’ARN extraits seront analysés à la plateforme technologique de SciLife Labs pour le séquençage de l’ensemble du transcriptome.

Effectuer une analyse protéomique par spectrométrie de masse à haute résolution et une analyse métabolomique par spectrométrie de masse à haute résolution et RMN. Nous pouvons également compléter l’analyse des protéines par un panel Olink inflammatoire.

Étude B :

Étudier les symptômes persistants après 24 et 36 mois chez les patients (sélectionnés dans l’étude COMBAT, 150 au total) après une infection légère confirmée par la covid-19 et comment les symptômes éventuels affectent les activités quotidiennes et la capacité à travailler ainsi que les congés maladie.

Étudier si les patients présentant des symptômes persistants ont une capacité physique et une force musculaire affectées.

Étudier si les patients présentant des symptômes persistants ont des niveaux élevés de biomarqueurs inflammatoires (protéines, métabolites) et/ou d’auto-anticorps par rapport à ceux qui ne présentent pas de symptômes 24 mois après une infection légère à la covid-19.

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Microvésicules et séquençage viral

Les microvésicules sont un type de vésicule extracellulaire qui est libérée de la membrane cellulaire. Les vésicules sont de petits sacs ou vacuoles remplis de liquide dans l'organisme. Le séquençage est une technique utilisée pour déterminer la séquence exacte des bases (A, C, G et T) dans une molécule d'ADN (ou virale).

NMR Metabolomics
NMR (Nuclear Magnetic Resonance) is an instrument/tool used to perform metabolic studies, metabolic profiling, and metabolomics in biofluids and tissues for more than 40 years using magnetic fields. There is a very close connection between metabolic measurements and NMR. This connection has flourished because of NMR’s many unique strengths for characterizing complex mixtures’ chemical composition.
Protéomique

L'étude à grande échelle des protéines, qui sont de grandes molécules complexes nécessaires à la structure, à la fonction et à la régulation des tissus et des organes du corps humain.

Autoanticorps

Les anticorps qui réagissent avec les molécules de l'organisme et qui sont présents chez les personnes en bonne santé sont appelés anticorps naturels ou auto-anticorps.

L'ADN extracellulaire pour la réactivation virale

L'ADN extracellulaire est souvent sécrété activement et est utilisé pour effectuer plusieurs tâches, offrant ainsi une cible ou un outil attrayant pour les applications biotechnologiques, médicales, environnementales et microbiologiques générales. Les virus sont des parasites intracellulaires qui dépendent dans une large mesure de la cellule hôte pour leur réplication. La réactivation virale se produit lorsqu'une réplication active du génome viral entraîne une infection lytique (dégradation de la cellule) caractérisée par la libération de nouvelles particules virales progénitrices (descendantes).

Profilage des cellules immunitaires

Le système immunitaire joue de nombreux rôles régulateurs importants dans le développement et la progression des maladies. Compte tenu de l'émergence de thérapies immunitaires efficaces, des prédicteurs fiables de la réponse sont nécessaires. Le profilage des cellules immunitaires détermine la réponse en évaluant les populations de cellules immunitaires provenant d'échantillons traités et non traités. Dans notre cas, nous évaluerons la réponse des globules blancs à l'infection virale en utilisant un procédé appelé "Cytof".

Génomique des leucocytes

Un leucocyte est une cellule incolore qui circule dans le sang et les liquides organiques et qui est impliqué dans la lutte contre les substances étrangères et les maladies. Un génome est l'ensemble du matériel génétique d'un organisme. La génomique est un domaine de la biologie qui se concentre sur la structure, la fonction, l'évolution, la cartographie et l'édition des génomes. Par conséquent, la génomique leucocytaire est l'étude de tout le matériel génétique des leucocytes.

Métabolomique

Métabolomique est une façon d'étudier le métabolisme, c'est-à-dire de mesurer les quantités de métabolites (petites molécules) produites par notre corps lorsque nous transformons les aliments en énergie et autres molécules dont nos cellules ont besoin pour survivre. La technologie métabolomique est "à grande échelle", ce qui signifie que plusieurs milliers de métabolites peuvent être mesurés à partir d'un seul échantillon, par exemple de sang ou d'urine.

Micro ARN

Les cellules utilisent le Micro ARN pour contrôler si un gène particulier produit trop, trop peu ou la quantité normale de sa protéine à un moment donné.